故事发生在100多年后的地球，严酷的地表环境和疯狂肆虐的病毒让人类引燃了地表所有的核弹，执行“艾拉毁灭计划”，并转移到位于地下20公里的地下城生活。为了给人类拓展更多生存空间，地下城内负责“百人号”时空穿梭机项目研究的赵琳因一次“M谷地”信号对接任务失败，被偷偷潜入地表做违禁实验室的梁义山救下。赶去地表接梁义山的准嫂子方宝儿将利用方氏大小姐的特殊时空电梯将两人救回地下城。经方万年推荐，赵琳进入了克里西政府军，参与地下城拓展计划执行时空穿梭机运输任务。而此时，飞蝗突袭了地下城的地表安全区。巡检队总队长李子涵带领全队出地表应战。梁义山的哥哥梁明山作为巡检队一员也参与了此次战役。大战后，李子涵负伤成为艾拉病毒高度感染者。梁明山等人也被卷入了一场生物病毒改造和地下城暴乱的阴谋中。艾拉病毒、巨型变异虫、地核变异兽等陆续成为地下城的威胁。一场来自地勤兵和地面反抗义军的政变由此爆发。
面对即将停转的地球、面对日益肆虐的艾拉变异病毒和变种虫兽，面对心怀叵测、人心各异的人类，坚定而勇敢的梁家兄弟、善良而正义的赵琳，率真而质朴的燕子等人又将如何闯过这层层险阻，揭开阴谋的秘密，完成人类和地球的救赎？